需要刪除修改的部分：
1、保持DEDE更新，及時打補丁。
2、裝好DEDE后及時把install文件夾刪除
3、后臺目錄改名，最好是改成MD5形式的，最好長點
4、如果是使用HTML可以把plus下的相應文件和根目錄下的index.php做掉（用不到的全刪掉，還可以把數據庫里面不用的表刪除掉）
5、不用留言本的可以把plus下的guestbook做掉
6、不用會員的可以把member做掉
7、后臺的文件管理（管理目錄下file_manage_xxx.php），不用的可以做掉，這個不是很安全，至少進了后臺上傳小馬很方便
8、下載發(fā)布功能（管理目錄下soft__xxx_xxx.php），不用的話可以做掉，這個也比較容易上傳小馬的
9、安裝的時候數據庫的表前綴，最好改一下，不用dedecms默認的前綴dede_,可以改成ljs_,隨便一個名稱即可。
10、后臺登錄開啟驗證碼功能，將默認管理員admin刪除，改成一個自己專用的，復雜點的賬號。
11、用不到的功能一概關閉，比如會員、評論等，如果沒有必要通通在后臺關閉。
12、以下一些是可以刪除的目錄：
member會員功能
special專題功能
company企業(yè)模塊
plus\guestbook留言板
13、以下是可以刪除的文件：
后臺目錄下的這些文件是后臺文件管理器，屬于多余功能，而且最影響安全
file_manage_control.php file_manage_main.php file_manage_view.php media_add.php media_edit.php media_main.php
14.data目錄路徑更改
另外在DedeCMS V5.7中用戶也可以設定data目錄到上一級非web訪問目錄，基本操作如下：
1.將data目錄移動到上一級目錄中，這里直接剪切過去就可以了；
2.配置include/common.inc.php中DEDEDATA文件
define(‘DEDEDATA’, DEDEROOT.’/data’);
可以改成類如：
define(‘DEDEDATA’, DEDEROOT.’/http://www.cnblogs.com/data’);
15、不需要SQL命令運行器的將dede/sys_sql_query.php 文件刪除。
16、不需要tag功能請將根目錄下的tag.php刪除。不需要頂客請將根目錄下的digg.php與diggindex.php刪除。
17、多關注dedecms官方發(fā)布的安全補丁，及時打上補丁。
18、下載發(fā)布功能（管理目錄下soft__xxx_xxx.php），不用的話可以刪掉，這個也比較容易上傳小馬的.
19、最安全的方式：本地發(fā)布html，然后上傳到空間。不包含任何動態(tài)內容，理論上最安全，不過維護相對來說比較麻煩。
20，還是得經常檢查自己的網站，被掛黑鏈是小事，被掛木馬或刪程序就很慘了，運氣不好的話，排名也會跟著掉。所以還得記得時常備份數據.
21、不需要專題的，建議刪除special 目錄，需要可以在生成HTML后，刪除special/index.php 然后把這目錄設置為可讀寫，不可執(zhí)行的權限；

權限設置部分：
1、 data、templets、uploads、a或5.3的html目錄，設置可讀寫，不可執(zhí)行的權限；
2、 include、member、plus、后臺管理目錄設置為可執(zhí)行腳本，可讀，但不可寫入（安裝了附加模塊的，book、ask、company、group 目錄同樣如此設置）。

數據庫部分設置：
1、 不要對網站直接使用MySQL root用戶的權限，給每個網站設置獨立的MySQL用戶帳號，許可權限為：
SELECT, INSERT , UPDATE , DELETE
CREATE , DROP , INDEX , ALTER , CREATE TEMPORARY TABLES
由于DEDE并沒有任何地方使用存儲過程，因此務必禁用FILE、EXECUTE 等執(zhí)行存儲過程或文件操作的權限。