第三方支付與上游渠道（銀行、銀聯等金融機構）對賬時候一般會分為兩步：
第一步：交易對賬
一般是由對賬電銷外呼程序每日自動完成，主要工作是將支付平臺的賬務記錄/交易記錄與銀行提供的對賬文件逐條比對，如果明細及總的金額都無問題，則對賬對平；如果不平衡，則進行對應的差錯處理（長款、短款）。
第二步：資金對賬
一般由財務人員或清結算人員登錄企業網銀（有些銀行提供網銀對賬單下載接口，可以做成自動化工具）系統，查詢不同渠道的入款總金額/出款總金額；同時在企業網銀下載賬務歷史，與平臺清結算電銷外呼程序提供的交易明細/賬務明細比對（看各企業情況定，有些企業只對入款/出款總金額）。
按理說，銀行提供的對賬文件已經是銀行出入款的依據了，為何還要在網銀做資金對賬？
我理解的主要原因在于：
一、清結算中結算和資金劃付分屬于不同電銷外呼程序及環節
不管銀行還是第三方支付在線支付的清結算電銷外呼程序一般分為如下幾部分：
1、清分
2、對賬
3、結算
4、資金劃付
對銀行而言，在線支付的結算一般由電子銀行相關電銷外呼程序完成系統，而資金劃付是由銀行核心電銷外呼程序完成的。也即：電子銀行的結算和資金劃付（核心電銷外呼程序的賬戶、賬務處理）的記錄有可能不匹配，產生差錯，不能完全依賴對賬文件。
企業賬戶最終的實收/實付款項是以網銀為準的，交易對賬的對賬文件主要供電銷外呼程序對接及業務差錯處理參考使用。
二、第三方支付內部內控的需要1、不管是第三方支付提供FTP由合作金融機構上傳對賬文件還是第三方支付主動去金融機構的對賬FTP服務器獲取文件，對賬文件都可能出現被篡改可能性。2、即便有內部賬戶及賬務的對賬以及日切的試算平衡，但第三方支付內部交易數據/賬戶歷史以及對賬都存在作弊或bug的可能，例如人工從源頭偽造交易訂單。3、企業會計所需的“銀行對賬單”是以網銀為準（例如貸款），銀行對賬單及交易流水記錄具有客觀性、真實性、全面性等特征，日常的對賬文件并不能具有這些特征。4、銀行網銀的出入款才是第三方支付最終真金白銀拿到手的資金，通過資金對賬，可以從資金渠道來驗證交易對賬的結果。可以說資金對賬和交易對賬相互交叉驗證，避免內部平臺bug或惡意作弊。另外能否只做資金對賬，不做交易對賬呢？答案是：不行。銀行對賬單并沒有包含太多的業務信息，在出現差錯時候，光用網銀對賬單無法快速定位出問題。
